Le clergé a dû lâcher prise peu à peu, au fur et à mesure que la monarchie affirmait son pouvoir. C'est avec l'affirmation de la monarchie absolue que le clergé a perdu son influence, à la même époque que les grands seigneurs perdaient peu à peu prise face au pouvoir royal.
Il faut se souvenir de plus que le clergé n'était pas si intégriste que cela. Le haut clergé était composé de nobles qui vivaient comme des seigneurs, se mêlaient des affaires du monde, et ne se privaient de rien.
A se demander même s'ils avaient la foi, comme pouvaient encore l'avoir le bas peuple et ses curés. Les philosophies nouvelles ont surtout été combattues - au début - parce qu'elles remettaient en cause l'ordre établi, la pyramide sociale, bien plus que pour des raisons de foi.
Du 16e s. au 18e s. l'évolution de l'Eglise a accompagné les mutations sociales et politiques.